In deinem speziellen Fall spielt \(a\geq 0\) gar keine Rolle, da
\(\cos(-z) = \cos z\)
In deinem Fall kann man also immer \(a\geq 0\) annehmen.
Nun zur Verwendung der Polstellen. Ich empfehle, nochmal die Herleitung der Integrationsregeln per Residuensatz anzuschauen:
Man wählt einen geschlossenen Weg in \(\mathbb C\), sodass
(1) der Teilweg \([-r,r]\) für alle \(r>0\) enthalten ist,
(2) für \(r \to \infty\) das komplexe Wegintegral über die restlichen Teilwege gegen null geht
Möglichst einfache Wege, die hierbei genutzt werden, sind meist der Halbkreis oder das Rechteck, die dann üblicherweise in der oberen Halbebene gewählt werden. Daher werden nur die Polstellen in der oberen Halbebenen benutzt.
Um (2) zu erzielen, müssen außerdem die Integrale über die restlichen Teilwege geeignet abgeschätzt werden. Dein Integral ist ein Spezialfall von \(\int_{-\infty}^\infty \frac{P(x)}{Q(x)}e^{iax}\, dx\). Um diese Art der Integrale mit dem Residuensatz im Allgemeinen bestimmen zu können, benötigt man \(a > 0\), um die passenden Abschätzungen zu erhalten.